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  • PATIENT AREA
    患者專(zhuān)區
    • mNGS能夠給臨床患者解決什么問(wèn)題

      面對重癥感染患者,能否快速確認感染性疾病原體,成為后續對癥治療的關(guān)鍵。傳統的微生物鑒定方法分為培養和非培養兩類(lèi),臨床公認的“金標準”是分離培養和生化鑒定,這種方法的操作周期長(cháng)、失敗率高,并且不是每種病原體都可以培養。不依賴(lài)培養的方法比如涂片鏡檢、抗體抗原免疫等,在采樣當天即可報告結果。這些方法的時(shí)效性強,但在敏感性和特異性上存在較明顯的劣勢,而且傳統的微生物鑒定方法對于未知或者罕見(jiàn)的病原微生物,無(wú)法快速識別。

      mNGS不依賴(lài)于傳統的微生物培養,也無(wú)需特異性擴增,直接對臨床樣本中的核酸進(jìn)行無(wú)差別、無(wú)選擇性的高通量測序,然后與已知的微生物序列數據庫進(jìn)行比對分析,根據比對到的序列信息來(lái)判斷樣本包含的病原微生物種類(lèi),能夠快速、客觀(guān)地檢測臨床樣本中的病原微生物(包括病毒、細菌、真菌、寄生蟲(chóng))

      目前已經(jīng)有數十篇mNGS專(zhuān)家共識中提到,對于一些危重癥感染患者,建議留取合適的標本,進(jìn)行mNGS檢測,更快更精準的幫助臨床找到感染性疾病原體,從而精準使用抗生素。

    • 做了mNGS檢測結果應該怎么看

      拿到一份mNGS報告應該關(guān)注以下專(zhuān)業(yè)名詞:

      l讀長(cháng):測序儀單個(gè)測序反應所得到的堿基序列。讀長(cháng)長(cháng)度指該堿基序列的堿基數。讀長(cháng)數量指測序獲得的堿基序列的數量。

      l相對豐度:指除去宿主序列之后,某微生物物種序列在相應大類(lèi)物種(通常分成細菌、真菌、病毒、寄生蟲(chóng)4大類(lèi))中的分布比例。豐度越高,表示該物種所占比例越高。

      l檢出限(limit of detection,LOD):指檢測對象可以被某特定方法可靠地檢測到的最低濃度(嚴格意義上是達到某概率的最低檢測濃度)。

      l比對:指將測序的讀長(cháng)與參考基因組進(jìn)行匹配的過(guò)程。

      l檢出序列數(reads):配到該病原體的序列數目,其多少與標本中病原體本身載量負荷、核酸提取量、人源序列比例有關(guān)。序列數越高,表示標本中檢測到該病原體的可信度越高。

      llmNGS報告具體如何解讀建議進(jìn)一步詢(xún)問(wèn)臨床醫生。

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